Akreditasi merupakan Sistem Penjaminan Mutu Eksternal sebagai bagian dari Sistem Penjaminan Mutu Pendidikan Tinggi. Akreditasi menjamin mutu Program Studi secara eksternal baik bidang akademik maupun non akademik untuk melindungi kepentingan mahasiswa dan masyarakat. Akreditasi dilakukan terhadap Program Studi berdasarkan interaksi antar standar di dalam Standar Pendidikan Tinggi. Luaran proses akreditasi dinyatakan dengan status akreditasi Program Studi, dengan peringkat: terakreditasi baik, terakreditasi baik sekali, dan terakreditasi unggul.
Program Studi Doktor Ilmu Kedokteran dan Kesehatan FK-KMK UGM berhasil mempertahankan akreditasi LAM-PTKes dengan status “Unggul” dan meningkatkan nilai akreditasi menjadi 378 berdasarkan SK LAM-PTKes nomor 0302/LAMPTKes/Akr/Dok/IV/2022 yang ditetapkan tanggal 22 April 2022 dari Lembaga Akreditasi Mandiri Pendidikan Tinggi Kesehatan (LAM-PTKes) berbasis borang akreditasi 7 standar. SK akreditasi berlaku sampai 25 Februari 2026.
